本申请提供KEGG Pathway map组学维度信息的交互式展示方法,系统,终端,介质,本发明通过对KEGG Pathway Map中元素的填充色,边框和单词(或数字)进行颜色映射的方式同时批量展示单一或多组学元素的变化水平,表达水平,显著水平,各种修饰水平(如甲基化水平)或突变频率等信息;同时依据html规则与JavaScript脚本以网页版的形式交互...
检查通过,并且参数选好后,点击“提交”按钮,约15s后(后台需要从KEGG官网下载数据),会在页面上显示pathway map预览图。由于该图是在KEGG Pathway Map的基础上,对图片进行上色后获得的图,因此,仅提供了300 dpi png格式图片供下载。 在这张KEGG Pathway Map中,红色表示基因表达上调,绿色表示基因表达下调。黄色表示化合...
上海生物芯片取得KEGG Pathway map组学维度信息的交互式展示方法等专利 金融界2024年11月13日消息，国家知识产权局信息显示，上海生物芯片有限公司取得一项名为“KEGG Pathway map组学维度信息的交互式展示方法、系统、终端、介质”的专利，授权公告号CN 114283892 B，申请日期为2021年12月。本文源自：金融界 作者：情报...
1)map -Reference pathway对于代谢相关的通路,在reference pathway中,一个点同时表示一个基因、这个基因编码的酶及这个酶参加的反应 2)ko -Reference pathway (KO)ko通路中的点只表示基因, 即K编号表示一个基因,是ko通路中的基本单位 3)ec -Reference pathway (EC)ec通路中的点只表示相关的酶 4)rn -Reference...
金融界2024年11月13日消息,国家知识产权局信息显示,上海生物芯片有限公司取得一项名为“KEGG Pathway map组学维度信息的交互式展示方法、系统、终端、介质”的专利,授权公告号CN 114283892 B,申请日期为2021年12月。
http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?map00010 第⼆类、species-specific pathway：物种特有代谢通路图。绿⾊⼩框为该物种特有的基因或酶，只有这些绿⾊的框有更详细的信息。KEGG中名字为特定物种种属英⽂缩写，⽐如⼈的糖酵解通路图，hsa00010。http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway...
摘要 本申请提供KEGG Pathway map组学维度信息的交互式展示方法、系统、终端、介质,本发明通过对KEGG Pathway Map中元素的填充色、边框和单词(或数字)进行颜色映射的方式同时批量展示单一或多组学元素的变化水平、表达水平、显著水平、各种修饰水平(如甲基化水平)或突变频率等信息;同时依据html规则与JavaScript脚本以网页...
再点击三级分类的通路,就发现我们想要的pathway map了。例如这里我们点击三级分类pathway map的“cell cycle”,然后就得到了下面这样的通路。 注意哈,一般默认是人的pathway,如果要查看其他物种的pathway,你需要点击左上角的Change pathway type,在弹出来的选项框中选择你所关注的物种,如下图所示。
第一类、reference pathway:根据已有的知识绘制的、概括的、详尽的具有一般参考意义的代谢图。通路图中的小框都是白色,方便个性化填充颜色,在KEGG中名字以map开头,节点代表某一基因、该基因编码的酶及这个酶参与的反应,比如map00010; http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?map00010 ...
KEGG Pathway Map Illustrate 界面简介 从其中可以看到,输入简单,具体输入文件 1. 通路数据库文件 这一文件,可直接下载已经准备好的文件。注意,只要运行一次就行,下次重启 TBtools 也不需要重新加载。 https://tbtools.cowtransfer.com/s/0634098bb24441