常见的原发性脑肿瘤体外模型有脑肿瘤细胞株培养、3D类器官培养以及器官型脑切片培养模型等。 1.1 脑肿瘤细胞株模型 脑肿瘤细胞株培养的原发性脑肿瘤模型不常用,其通常是培养单层的肿瘤细胞如大鼠脑胶质瘤C6细胞、大鼠胶质肉瘤9L细胞、人脑星形胶质母细胞瘤U⁃87MG、人源的原发性脑肿瘤细胞等,通常用来探究脑肿瘤内...
模式小鼠具有基因组信息清晰且与人相似度高、繁育速度快、成本低、应用广、易于进行基因编辑等诸多优点,通常被用来构建理想的肿瘤模型。 由于促使人类肿瘤发生的大部分基因突变,都可以通过基因编辑在小鼠上实现,基因修饰原发肿瘤小鼠模型应运而生。通过编辑癌基因或抑癌基因使其体内自发生成肿瘤,能够再现肿瘤的分子和组织...
TORCH模型训练的基础是使用了深度卷积神经网络(deep convolutional neural networks),这种网络能够从细胞学图像中学习到区分肿瘤类型和起源的特征。研究中涉及的神经网络模型分别针对12种不同类型的肿瘤训练,包括食管癌、胃癌、肠癌、结直肠癌、...
本发明提出一种全新的肿瘤动物模型构建方法,通过直接注射癌症相关基因表达质粒和转座酶质粒的混合溶液到目标器官或目标组织中即可诱发原位肿瘤形成。 2、本说明书实施例之一提供了一种构建原位原发肿瘤动物模型的方法,用于非诊断或治疗目的,包括:配制至少一种质粒混合溶液,其中,所述至少一种质粒混合溶液包含一个或多个...
1.能模拟人类原发性肺癌,是一个很好的原发疾病模型。这样可以尽最大可能模拟一些人类疾病的发病过程,因此,在这种模型上的实验可信度和实用度都很高。 2.特异性好,他们用的CCSP-rtTA只有在肺泡中有表达,(CCSP是Clara Cell Secretion Protein的简写,这种蛋白只会在肺泡表达,CCSP-rtTA指的是用CCSP的启动子调控rtTA的...
研究团队利用简化甲基化测序技术(RRBS),优化了针对石蜡包埋FFPE样本RRBS建库方法,基于机器学习及大样本多中心的系统评估,成功建立了原发灶不明肿瘤溯源模型(BELIVE)及新型诊断方法。 第一作者:张仕蓉,通讯作者:马胜林 研究背景 原发灶不明...
这里,我们借助从The Cancer Genome Atlas(TCGA)和The Cancer Cell Line Encyclopedia(CCLE)数据库中获得的转录组结构数据对泛癌做综合性分析,来评价常作为肿瘤模型的22种肿瘤细胞。我们做了相关性分析和基因富集分析比较了细胞株和原发肿瘤的不同点。并且,我们在9种肿瘤中将细胞株划分成肿瘤亚型。我以胰腺癌的分析...
在此次研究中,望石团队开发了一种深度学习模型MetaWise。该模型利用从TCGA和其他转移队列中获得的全外显子组测序数据计算得出的突变特征,可以有效区分转移性肿瘤和原发性肿瘤。此外,研究还发现非编码区域的突变特征对预测癌症转移风险也有重要影响。通过对模型预测结果进行解释性分析,望石团队确定了一些与不同肿瘤类型转...
原发性肝癌(简称肝癌)的发病率和病死率均居所有肿瘤的前5位[1], 是男性癌症相关死亡的第2大原因, 女性癌症死亡的第6大原因[2], 2015年中国统计数字显示, 肝癌是国内第4位恶性肿瘤, 肿瘤致死病因则位于第3位[3]。大数据时代, 随着人工智能的快速发展, 各种数学算法也在肝癌的海量数据中得到广泛应用, 数据挖...
他们使用了机器学习,创造了一个计算模型,利用肿瘤的基因测序数据进行训练后,可以根据这些信息来有效预测癌症的原发部位,为更多CUP患者提供基因组信息指导个体化的靶向治疗。研究人员把这种癌症类型分类器命名为OncoNPC,并将相关研究成果发表在了《自然-医学》杂志上。