如果两个样本之间存在显著的孟德尔随机化关系,那么它们之间的遗传变异可能会影响表型的结果。 统计量结果:孟德尔随机化的结果通常会以P值的形式呈现。如果P值较小,则表明遗传变异对表型的影响较大,因此遗传因素可能是导致表型差异的主要原因。 遗传变异类型:孟德尔随机化分析可以区分不同类型遗传变异的影响,如单核苷酸...
双样本孟德尔随机化方法 双样本孟德尔随机化方法是一种利用遗传变异作为工具变量来推导暴露与结果变量之间因果关系的方法。这种方法需要两个样本,一个用于估计暴露与遗传变异之间的关联,另一个用于估计遗传变异与结果之间的关联。然后通过这两个样本,可以推导出暴露与结果之间的关联。 为了实现有效且无偏的估计,该方法需要...
孟德尔随机化(Mendelian Randomization,MR)是通 过提取与暴露因素强关联的核苷酸多态性(Single NucleotidePolymorphism,SNP)作为工具变量来寻找暴露与结果之间的因果关系的一种研究方法,其结论较队列研究及病例 - 对照研究都更为可靠,因此提供了...
两样本孟德尔随机化(2SMR)是使用GWAS概括性数据估计暴露对结果的因果效应的一种方法,其核心是运用遗传学数据作为桥梁,来探索某一暴露和某一结局之间的因果关联。 光宝之前分享的MR文章基本都是以国外数据库为主,今天,光宝找到了一篇使用国内数据库进行两样本孟德尔随机化分析的文章,该研究在中国肺血栓栓塞登记研究(CURE...
两样本孟德尔随机化(Two sample Mendelian randomisation,2SMR)是使用GWAS概括性数据估计暴露对结果的因果效应的一种方法。尽管孟德尔随机化在概念上相对直观简单,但实际操作却相对繁琐,有很多细节需要注意。TwoSampleMR就是一款致力于简化MR分析的R包,其整合了以下的分析步骤: ...
小结:我们在读取孟德尔随机化数据的时候,一般有两种读取方式,包括在线读取和本地读取方式。通常建议初学者可以先使用在线读取方式进行练习,然后在进行本地读取。而这两种方式的区别就是我们在线读取的数据一般比较久远,而本地数据读取可能因为数据保存的格式不同,整理起来稍显麻烦。好了,今天的分享就到这里,感兴趣的小...
2024年6月17日，上海交通大学的学者们采用孟德尔随机化的方法，在期刊《Nature Human Behaviour》（医学一区top，IF=21.4）发表题为：“Mendelian randomization evidence for the causal effect of mental well-being on healthy aging”的研究论文，该研究使用双样本孟德尔随机化的方法，评估心理幸福对遗传独立的衰老...
孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系 主要步骤: 1. 读取暴露因素GWAS数据 选取合适的工具变量(如有必要,需要进行clumping) 2. 读取结局GWAS数据,提取上述的工具变量的SNPs 3. 对暴露因素与结局的GWAS数据进行预处理,使其格式统一 4. 采用选中的MR方法进行分析 ...
方法:采用连锁不平衡评分(LDSC)评估PM2.5与骨密度的遗传相关性,采用两样本孟德尔随机化(TSMR)评估PM2.5与骨密度的因果关系。采用两步孟德尔随机化(MR)方法评估炎症相关蛋白在PM2.5与骨密度因果关联中的潜在作用。多变量孟德尔随机化(MVMR)研究旨在进行中介分析,排除可能的混杂因素,并计算中介比例。随后,我们使用...
两样本孟德尔随机化分析血脂与肌肉减少症的因果关系 背景:骨质疏松常伴有肌肉减少症的发生并增加摔倒骨折的风险。近年来的研究表明,脂质代谢与肌肉减少症之间存在密切关系。异常的脂质代谢可能对肌肉的生理功能和代谢产生直接的影响。 目的:探究...