print("Group 2:", group2)。 这段代码模拟了一个孟德尔随机化实验,其中有两个样本(`sample1`和`sample2`)。首先,将这两个样本合并到一个总体中(`population`),然后使用`random.shuffle`函数打乱总体中的元素顺序。接下来,将打乱后的样本重新分配到两个组(`group1`和`group2`)中,确保每个组中的样本数量相...
write.csv(b, file="exposure.csv") (#此步骤是最不同于在线读取的地方。我们需将写出的文件,整理为下方代码读取的格式,然后放在TwoSampleMR包所在的位置处) bmi<-system.file("exposure.csv",package="TwoSampleMR") bmi_exp_dat<-read_exposure_data(filename = bmi,sep = ",",snp_col ="SNP",beta...
write.csv(b, file="exposure.csv") (#此步骤是最不同于在线读取的地方。我们需将写出的文件,整理为下方代码读取的格式,然后放在TwoSampleMR包所在的位置处) bmi<-system.file("exposure.csv",package="TwoSampleMR") bmi_exp_dat<-read_exposure_data(filename = bmi,sep =",",snp_col ="SNP",beta_...
代码语言:javascript 复制 hyperten_tophits<-tophits(id="ukb-b-12493",clump=0)hyperten_gwas<-rename(hyperten_tophits,c("SNP"="rsid","effect_allele.exposure"="ea","other_allele.exposure"="nea","beta.exposure"="beta","se.exposure"="se","eaf.exposure"="eaf","pval.exposure"="p","N...
孟德尔已然是SCI的又一片蓝海,但随着发文量的飙升,可做的内容越来越多了,普通医生该怎么选择呢?单样本主要问题是:弱工具偏倚优势:自由度高,更容易有新颖性,还可以检验暴露和结果变量之间的非线性因果关系,以及分组的异质性分析缺点:对数据资源要求高很多,样本量不够大会导致统计力偏低,分析代码更复杂双样本主要问题...