3月7日，同济大学附属同济医院王晨飞课题组在nucleic acids research杂志上发表文章stride: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell rna sequencing，开发了空间转录组与单细胞整合分析工具stride，通过机器学习方法及数据整合，将空间转录组学数据提升至单细胞精度。高通量单细胞测序...
2024年7月18日,同济大学王晨飞课题组在Bioinformatics杂志上在线发表文章Single-cell and spatial multiomic inference of gene regulatory networks using SCRIPro,开发了基于单细胞及空间多组学数据构建基因调控网络的工具SCRIPro(https://github.com/wanglabtongji/SCRIPro)。 SCRIPro首先通过考虑表达及空间相似性,将临近...
同济大学生命科学与技术学院王晨飞课题组聚焦于单细胞及空间多组学智能算法与大模型开发,研究细胞命运决定的基本调控规律。因实验室建设发展需求,现诚招科研助理1名,博士后2名。热忱邀请有志科研同道加入本课题组。 研究方向: 1.单细胞空间多组学智能算法开发 2.表观及代谢重编程对细胞命运决定的调控机制 3.衰老及免...
3月7日,同济大学附属同济医院王晨飞课题组在Nucleic Acids Research杂志上发表文章STRIDE: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell RNA sequencing,开发了空间转录组与单细胞整合分析工具STRIDE,通过机器学...
Genome Biology|王晨飞课题组整合单细胞与空间转录组数据构建细胞间相互作用预测方法评估流程 细胞间相互作用(Cell-cell interaction,CCI)是多细胞生物生命活动的基础。细胞之间可以通过配体、受体、代谢物等信号分子进行信号传递,并构成复杂的...
Genome Biology|王晨飞课题组整合单细胞与空间转录组数据构建细胞间相互作用预测方法评估流程同济大学 2023-01-15 57 细胞间相互作用(Cell-cell interaction, CCI)是多细胞生物生命活动的基础。细胞之间可以通过配体、受体、代谢物等信号分子进行信号传递,并构成复杂的相互作用网络,从而与细胞内调控网络一并实现对细胞...
同济大学生命科学与技术学院王晨飞课题组2023年诚聘科研助理与博士后,同济大学生命科学与技术学院王晨飞课题组聚焦于单细胞及空间多组学智能算法与大模型开发,研究细胞命运决定的基本调控规律。因实验室建设发展需求,现诚招科研助理1名,博士后2名。热忱邀请有志科研同道
2022年9月26日,同济大学王晨飞课题组在Nucleic Acids Research杂志上在线发表文章Single-cell gene regulation network inference by large-scale data integration,开发了基于scATAC-seq数据构建基因调控网络的工具SCRIP,基于数据检索和调控潜能模型算法,整合scATAC-seq数据及海量公共数据集来源的转录因子结合数据,衡量单细胞...
同济大学王晨飞课题组聚焦单细胞及空间多组学数据机器学习方法开发,并将其应用于解决肿瘤免疫微环境、胚胎发育过程中表观修饰及空间信息的异质性,探索其对细胞状态改变及命运决定的调控机制。课题组长期招收计算生物学、单细胞多组学方向的研究生及博士后,欢迎大家加入,联系邮箱:08chenfeiwang@tongji.edu.cn。
同济大学王晨飞课题组聚焦单细胞及空间多组学数据机器学习方法开发,并将其应用于解决肿瘤免疫微环境、胚胎发育过程中表观修饰及空间信息的异质性,探索其对细胞状态改变及命运决定的调控机制。课题组长期招收计算生物学、单细胞多组学方向的研究生及博士后,欢迎大家加入,联系邮箱:08chenfeiwang@tongji.edu.cn。