以槲树高质量基因组图谱为基础,通过整合不同叶色转变时期的转录组和代谢组数据,深入探索秋色叶变色和衰老过程中的分子调控机制,可为栎属植物的适应性和基因组功能研究提供基础。 近日,New Phytologist在线发表了题为“Chromosome-scale genome assembly and insights into the metabolome and gene regulation of leaf col...
生态所陈军课题组在Nature Ecology & Evolution发文揭示两种同域分布的栎属植物在全基因组范围上的渐渗模式 栎树,俗称橡树,是北半球分布最广、适应性最强、物种最丰富的树木属之一。栎树通常能活几百年,在漫长的生命周期中对各种非生物和...
其次,以49个栎属物种(代表中国分布的4个组)的51个完整质体基因组为研究对象,探讨中国栎属植物系统发育框架和进化历史。 最后,本研究探讨质体基因组推断壳斗科主要属的系统发育框架的有效性。本论文的主要研究结果和结论如下:1.5个栎属植物完整质体基因组比较分析利用二代测序技术和参考指导组装(reference-guided ...
通过ＩＲ边界分析得出ꎬ４种栎属青冈亚属植物存在ｙｃｆ１假基因且在ＩＲｂ/ＳＳＣ区域发生扩张ꎮ(４)系统发育分析显示ꎬ在壳斗科中ꎬ水青冈属(Ｆａｇｕｓ)和轮叶三棱栎属(Ｔｒｉｇｏｎｏｂａｌａｎｕｓ)较早分化出来ꎬ栎亚属(ｓｕｂｇ.Ｑｕｅｒｃｕｓ)未形成一个单系群ꎬ叶绿体基因组建树结果和核标记...
栎属植物(QuercusL.)统称为橡树或栎树,是北半球温带与亚热带森林最重要的生态建群种。其中,槲树(Quercus dentata)作为栎属米索组物种,广泛分布于东北亚地区,槲树树龄长,树型高大,生态适应性强,其叶片大且叶型奇特,秋色叶为红色,次生代谢产物丰富,经济和景观价值高,是典型的多功能生态景观树种。尽管槲树有很大的潜...
比较基于不同密码子位置密码子12位和密码子第3位和基因功能组数据构建的壳斗科系统发育摘要iii框架最终密码子12位数据集基本恢复壳斗科主要属的系统发育关系并获得高支持率表明密码子组成偏好对壳斗科质体系统发育推断有很大影响 中国栎属植物和壳斗科主要属质体基因组比较分析和系统发育研究 壳斗科栎属(Quercus)是北...