患者入ICU信息存储在mimic_icu.icustays表中，intime为患者入ICU的时间。我们的思路是根据患者的subject_id分组 （分组SQL我们一般使用：group by 或者 partition by ）然后以intime升序排序，看每行记录对应的是该患者第几次入ICU，最后取第一次入ICU的，即为首次入ICU信息。比如233患者三次入ICU，我们需要根据入I...
使用DATETIME_SUB函数把入ICU时间减去6个小时使用DATETIME_ADD函数把入ICU时间加上24个小时 得出了一个时间范围，最后再通过这个时间范围，判断实验室指标的采集时间是不是在这个时间范围内就能提取出入ICU24小时内的指标了 三、DATETIME_ADD 收录于合集 #mimic数据库 14个 上一篇MIMIC数据提取教程 - 如何提取外科患者...
我们前面生成患者入ICU顺序的语句放到stay_order_view这个临时表中,然后从stay_order_view中获取in_order=1的所有数据,查询结果如下,可以看到提取出了患者首次入ICU的stay_id。 然后如果要获取患者首次入ICU的其他信息,只需要用该查询结果中的stay_id或者hadm_id在其他表进行关联查询即可 1. 为什么使用partition by,...
七、 提取入住ICU第一天生命体征(血氧饱和度、血压、呼吸、体温) 打开mimic_derived文件夹里面的表first_day_vitalsign 这个表是由官方代码 mimic-iv/concepts_postgres/firstday/first_day_vitalsign.sql生成 MIMIC-IV的first_day_vitalsign视图提供了患者第一天测量的生命体征指标的最小、最大值与平均值 生命体征指标...
一、连接mimic-iv数据库 1.1 安装psycopg2包 1.2 导入包、连接数据库、查看所有表名 1.3 读取表...
MIMIC数据提取教程 - 提取入住ICU第一天生命体征(血氧饱和度、血压、呼吸、体温) 白鲸鱼 公众号: 科研收录 、柚子编程俱乐部 数据源:mimiciv数据库2.2版本 一、MIMIC数据库的subject_id,hadm_id,stay_id subject_id(患者标识符):这是用于唯一标识数据库中每个患者的数字标识符。(身份…阅读全文 赞同5...
MIMIC数据库常用的几个时间计算函数如下 一、DATETIME_DIFF函数 1.1 实例:获取某个患者在ICU待了多少个小时 如果要以天为单位,datepart参数换成'DAY' 结果保留两位小数 结果保留整数 1.2 实例:统计同等大小入院组的入院人数 (等宽直方图展示) 代码语言:javascript ...
四，提取红细胞计数 在第二步，阿毅已经从系统中获取到了红细胞积压的指标ID为51221，查询实验室指标，需要从表mimiciv_hosp.labevents表查询。同理，可以查询血小板计数 五，聚合数据 通常针对每个患者的每次住院记录，同一个指标可能会测量很多次，但是我们只需要每个指标取一个值进行分析即可，这就需要用到数据库...
首先我需要知道冠脉搭桥的icd编码都有哪些？因为是mimiciv数据库，表里面还混用了icd9 和 icd10，所以我们两个都要知道。https://www.findacode.com/ 可以从这个网站中查询icd9和icd10的操作和手术代码， 我们科研直接搜索查询 但是这种方法太慢了而且有可能遗漏， 其实我们可以直接问chatgpt， chatgpt对于这种确定...
二、如何提取mimic-iv内相关药物？因为是处方药，我们需要使用prescriptions表：它记录处方数据，记录了对患者开具的处方药物信息。subject_id：患者的唯一标识符。hadm_id：入院号，指患者的住院标识符。pharmacy_id：药房的唯一标识符。poe_id：医嘱输入/录入（Prescription Order Entry）的唯一标识符。poe_seq：医嘱...