铁死亡相关基因 铁死亡(Ferroptosis)是一种铁依赖性的细胞程序性死亡方式,其发生过程需要细胞内铁的聚集、脂质过氧化物和活性氧(ROS)的积累。细胞铁死亡的主要形态特征为线粒体皱缩,线粒体膜密度增加,线粒体嵴减少或消失。生化表现为谷胱甘肽(GSH)耗竭,谷胱甘肽过氧化物酶(GPX4)活性下降,脂质过氧化物增多和活性氧的聚...
铁死亡相关基因 铁死亡(Ferroptosis)是一种铁依赖性的细胞程序性死亡方式,其发生过程需要细胞内铁的聚集、脂质过氧化物和活性氧(ROS)的积累。细胞铁死亡的主要形态特征为线粒体皱缩,线粒体膜密度增加,线粒体嵴减少或消失。生化表现为谷胱甘肽(GSH)耗竭,谷胱甘肽过氧化物酶(GPX4)活性下...
1、从癌症基因组图谱(TCGA)获得直肠腺癌(READ)肿瘤样本和,从GEO获得GSE87211。从FerrDB数据库获得了人类FRG。人类蛋白质图谱(HPA)用于验证基因的免疫组织化学(IHC)染色。 2、根据 FRG 将 RC 分为两个聚类。分析这两组之间的铁死亡相关DEG(FRDEGs...
铁死亡的的本质是谷胱甘… 谱领代谢组学Profleader FerrDb — 铁死亡研究分析利器! 铁死亡(Ferroptosis)是一种铁依赖性的调节性细胞死亡方式,与多种人类疾病(例如癌症、心血管疾病和退行性疾病等)紧密相关。铁死亡的过程很复杂,由多种代谢物和生物分子组成,也有一些特… 云生信学生物信息 铁死亡十篇高分文章深入解读...
1.基于铁死亡相关lncRNA的预后特征 对TCGA-OV和GTEx的427个肿瘤样本和88个正常样本进行差异表达分析,鉴定出12505个差异表达的lncRNAs。然后对差异表达的lncRNAs和铁死亡相关基因之间进行Pearson相关分析,根据相关系数|R|>0.3和p<0.05得到1748个DEfrlncRNAs。再通过单变量Cox回归检测到157个预后相关的DEfrlncRNAs,和使用LASSO...
铁死亡相关基因 铁死亡是一种由于铁在体内积聚过多而引发的疾病,可能导致多种器官受损和功能障碍。目前,科学家们已经发现了一些与铁死亡相关的基因。 其中最为重要的基因是HFE基因,它编码的蛋白质是铁代谢中的重要调节因子。一些人的HFE基因可能会发生突变,导致其无法正常调节铁代谢。这样,他们的体内就会积聚过多的铁...
铁死亡相关基因是从FerrDb 数据库下载的。通过维恩图确定了胶质瘤中三个上调的铁死亡基因(FANCD2、EGFR和SLC40A1)和两个下调的铁死亡基因(GABARAPL1和TF)(图1A、B)。 图1 02 铁死亡基因表达与胶质瘤的预后 作者分析了FANCD2、EGFR、SLC40A1、GABARAPL1、TF在患者预后中的作用。FANCD2高表达的患者在所有WHO级别的...
发现这三种模型在TCGA数据上的1、2、3年AUC均低于本文的模型,说明具有良好的预测性能。 图8 小编总结 这类铁死亡相关基因的预后模型构建和免疫分析的文章之前也解读过,研究的思路和方法大致相似,但本文的模型通过与之前研究的模型进行比较,具有一定的优越性,这也可以给大家提供参考!
文章以铁死亡相关基因为出发点构建肝细胞癌预后模型,进而阐明铁死亡相关基因在肝癌中的预后价值! 摘要 背景:肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)是一种高度异质性疾病,其预后预测具有挑战性。铁死亡是一种铁依赖性的调节性细胞死亡形式,可由索拉非尼诱导。然而,铁死亡相关基因在肝癌中的预后价值仍有待进一步阐明。
文章以铁死亡相关基因为出发点构建肝细胞癌预后模型,进而阐明铁死亡相关基因在肝癌中的预后价值! 摘要 背景:肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)是一种高度异质性疾病,其预后预测具有挑战性。铁死亡是一种铁依赖性的调节性细胞死亡形式,可由索拉非尼诱导。然而,铁死亡相关基因在肝癌中的预后价值仍有待进一步阐明。