2024年7月18日,同济大学王晨飞课题组在Bioinformatics杂志上在线发表文章Single-cell and spatial multiomic inference of gene regulatory networks using SCRIPro,开发了基于单细胞及空间多组学数据构建基因调控网络的工具SCRIPro(https://github....
王晨飞 教授 同济大学 2012及2017年于同济大学生命科学与技术学院获得生物信息学学士及博士学位。2017-2020年分别在同济大学、美国哈佛大学Dana-Farber癌症研究所从事博士后研究。2020年受聘于同济大学生命科学与技术学院,历任特聘研究员、教授...
3月7日，同济大学附属同济医院王晨飞课题组在nucleic acids research杂志上发表文章stride: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell rna sequencing，开发了空间转录组与单细胞整合分析工具stride，通过机器学习方法及数据整合，将空间转录组学数据提升至单细胞精度。高通量单细胞测序...
2024年7月18日,同济大学王晨飞课题组在Bioinformatics杂志上在线发表文章Single-cell and spatial multiomic inference of gene regulatory networks using SCRIPro,开发了基于单细胞及空间多组学数据构建基因调控网络的工具SCRIPro(https://github.com/wanglabtongji/SCRIPro)。
同济大学生命科学与技术学院王晨飞课题组聚焦于单细胞及空间多组学智能算法与大模型开发,研究细胞命运决定的基本调控规律。因实验室建设发展需求,现诚招科研助理1名,博士后2名。热忱邀请有志科研同道加入本课题组。 研究方向: 1.单细胞空间多组学智能算法开发 ...
近日,同济大学附属上海市肺科医院张鹏课题组与同济大学生命科学与技术学院王晨飞课题组与合作,于Genome Medicine杂志在线发表题为Tumor Microenvironment Remodeling after Neoadjuvant Immunotherapy in Non-small Cell Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequencing的研究论文。该研究利用单细胞及大量细胞转录组测序(sin...
近日,同济大学王晨飞课题组和四川大学华西口腔医院李太文课题组合作在Nucleic Acids Research杂志上发表文章“HUSCH: an integrated single-cell transcriptome atlas for human tissue gene expression visualization and analyses”,建立了大规模人类多组织单细胞表达图谱数据库HUSCH(http://husch.comp-genomics.org)。(拓展...
近日,同济大学王晨飞、张敬课题组和四川大学华西口腔医院李太文课题组合作在Cell Reports Methods杂志上发表文章Single-cell Assignment using Multiple-Adversarial Domain Adaptation Network with Large-scale References,开发了基于AI和大数据整合的单细胞注释工具SELINA。
2022年9月26日,同济大学王晨飞课题组在Nucleic Acids Research杂志上在线发表文章Single-cell gene regulation network inference by large-scale data integration,开发了基于scATAC-seq数据构建基因调控网络的工具SCRIP,基于数据检索和调控潜能模型算法,整合scATAC-seq数据及海量公共数据集来源的转录因子结合数据,衡量单细胞...