在与木薯分化之后,橡胶树基因组在最近的一千万年以来有三个LTR逆转录转座子家族发生了快速爆发,使得橡胶树基因组增大了890Mbp(约60.44%);该研究鉴定得到与整个胶乳生物合成相关基因家族,并解析了胶乳生物合成
计算机模拟的全基因组鉴定过程涉及使用可用的数据库(NCBI和UniProt)在橡胶树孤立株MT/VB/25A 57/8和培育品种GT-1的基因组中鉴定PR-10蛋白质同源物。共鉴定出132个蛋白质候选物,其中包括来自橡胶树孤立株MT/VB/25A 57/8的65个蛋白质、来自橡胶树培育品种GT-1的61个蛋白质,以及两个橡胶树培育品种中的6个相同...
在与木薯分化之后,橡胶树基因组在最近的一千万年以来有三个LTR逆转录转座子家族发生了快速爆发,使得橡胶树基因组增大了890Mbp(约60.44%);该研究鉴定得到与整个胶乳生物合成相关基因家族,并解析了胶乳生物合成
Fig. 1 | 八个橡胶树物种的基因组组装和注释- 主要内容:本图展示了来自四个橡胶树(Hevea)物种的八个基因组的组装和注释统计信息。这些基因组包括三个高产量的巴西橡胶树品种(Hb)和三个其他Hevea物种。基因组大小估计在1.48到1.58 Gb之间,与之前通过流式细胞测量法报告的53个栽培Hb品种的基因组大小相当。基因组...
科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的染色体进化、胶乳生物合成与橡胶树的...
新华社客户端海口8月15日电(记者陈凯姿)8月14日至15日,由中国热带农业科学院与国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)联合主办的2024 IRRDB国际橡胶树泛基因组学与育种技术专题研讨会在海南三亚召开,来自7个国家的13个政府部门、科教机构...
近日,中国热科院橡胶所分子育种团队联合华北理工大学王希胤团队首次组装了野生橡胶树高质量基因组序列,利用全基因组关联分析挖掘了对橡胶产量贡献的遗传位点。研究结果提出了基因组杂合作物在驯化初期快速提升产量的可能机制,并为橡胶树育种提供了...
论文报道的橡胶树基因组组装大小为 1.37 Gb,N50 = 1.28 Mb,占估计的橡胶基因组大小(1.47Gb)的 93.8%。该文发现了REF/SRPP基因家族在橡胶中极大地扩张,似乎对橡胶的生物合成起决定性作用,并提出了橡胶物种进化和乙烯刺激产胶的新观点。该研究结果将极大推动产胶植物的产胶生物学研究,为橡胶树优异种质的发掘利用...
中新社海口2月15日电 (记者王晓斌)记者15日从中国热带农业科学院(简称“热科院”)获悉,该院橡胶研究所分子育种团队联合华北理工大学,在橡胶树基因组学和分子育种研究方面,提出了基因组杂合作物在驯化初期快速提升产量的可能机制。 橡胶树在东南亚栽培史不足150年,广泛栽培的魏克汉品种的奠基者仅有9株母树。在短暂的...
新华社客户端海口8月15日电(记者陈凯姿)8月14日至15日,由中国热带农业科学院与国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)联合主办的2024 IRRDB国际橡胶树泛基因组学与育种技术专题研讨会在海南三亚召开,来自7个国家的13个政府部门、科教机构和企业等90多名专家参加了会议。