孟德尔随机化代码实操!手把手教学第一课!纯干货分享!, 视频播放量 2071、弹幕量 3、点赞数 62、投硬币枚数 51、收藏人数 101、转发人数 19, 视频作者 Eric师兄, 作者简介 公粽号:医科新视界/答疑代码可t我!,相关视频:孟德尔随机化(MR)实操!新手入门绝佳之选!,孟
write.csv(b, file="exposure.csv") (#此步骤是最不同于在线读取的地方。我们需将写出的文件,整理为下方代码读取的格式,然后放在TwoSampleMR包所在的位置处) bmi<-system.file("exposure.csv",package="TwoSampleMR")bmi_exp_dat<-read_exposure_data(filename =bmi,sep = ",",snp_col ="SNP",beta_co...
孟德尔随机化代码实操3 此代码对应视频课程BVBV1NM4JeWEmf,希望会对大家有所帮助。 0.准备工作 #remotes::install_github("WSpiller/RMVMR", build_opts=c("--no-resave-data", "--no-manual"), build_vignettes = TRUE)#BiocManager::install("limma")library(TwoSampleMR)library(data.table)library(Vari...
write.csv(b, file="exposure.csv") (#此步骤是最不同于在线读取的地方。我们需将写出的文件,整理为下方代码读取的格式,然后放在TwoSampleMR包所在的位置处) bmi<-system.file("exposure.csv",package="TwoSampleMR") bmi_exp_dat<-read_exposure_data(filename = bmi,sep =",",snp_col ="SNP",beta_...
总的来说,Harmonization 的主要目标是确保数据的一致性和准确性,通过协同 SNP 方向、剔除无法判断方向的回文 SNP 和不兼容的 SNP,从而提高孟德尔随机化分析的质量和可靠性。这些步骤都是为了减少由于数据不一致或不匹配而引入的偏见和误差,使得分析结果更加准确和可靠。
代码语言:javascript 复制 #Fstatsforeach analysis anxiety_hyperten_liberal_meanF<-mean(harm_anxiety_hyperten_liberal$F) 比较两次的F均值有没有变化~ 到这步以后,其实就可以很好地与上上周的推文➡TwoSampleMR:孟德尔随机化一站式分析衔接起来啦,大家试试看吧...
2setwd("D:\\生物信息学\\MR自己写的笔记代码\\孟德尔随机化课程邀请函\\新建文件夹") 3#第一次使用,下载TwoSampleMR包,将下方俩行#去掉后分别运行 4#install.packages("remotes") 5#remotes::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR") 6#读取TwoSampleMR包,新手注...
966 -- 5:04 App 傻瓜式零代码孟德尔随机化实操-暴露数据-结局数据联合 6175 -- 13:41 App 基线分析-多组间差异比较-自动导出三线表【傻瓜式统计分析软件StatApp】 1257 -- 7:45 App 傻瓜式零代码孟德尔随机化实操-一键输出两样本孟德尔随机化所有结果 1569 -- 4:37 App 傻瓜式零代码孟德尔随机化实操-...
注:一般情况多变量孟德尔随机化分析就到这一步就停止了,作为对单变量分析的一个补充。因为后面的一些分析得到的结果不一定很理想。 04 补充部分 #安装包 #remotes::install_github("WSpiller/RMVMR",build_opts=c("--no-resave-data", "--no-manual"), build_vignettes = TRUE) ...
傻瓜式零代码孟德尔随机化实操-一键输出两样本孟德尔随机化所有结果SPSS数据分析大师 1134 0 13:41 基线分析-多组间差异比较-自动导出三线表【傻瓜式统计分析软件StatApp】SPSS数据分析大师 3791 0 08:36 SMR孟德尔随机化分析生信狂人团队 475 0 01:36 谁会拒绝看这么优秀的宝藏痛风孟德尔随机化选题医工科研...