水稻超级泛基因组的构建和优异等位基因快速挖掘的平台搭建(Shang et al., Cell Research, 2022;Lin et al., Journal of Integrative Plant Biology, 2023)、基因组复杂区域(Lv et al., Journal of Integrative Plant Biology, 2024)...
团队前期为了更好地挖掘和利用水稻种质资源中对育种有价值的优异自然变异,完成了水稻日本晴完整参考基因组的组装和高质量注释来提高对水稻自然变异的检测准确度(Shang et al., Molecular Plant, 2023);基于全世界核心种质群体捕获稻属的丰富遗传多样性的自然变异资源,进而构建了水稻图形超级泛基因组和高精度的结构变异...
中国农业科学院农业基因组研究所, 研究员,Pi 加为联系人 0 项目 34 成果 学科分类 作物基因组及遗传学 作物育种学 关键词 群体基因组学 功能基因组学 工作经历 中国农业科学院农业基因组研究所 研究员, 2021-12 - 现在 中国农业科学院农业基因组研究所 副研究员, 2019-06 - 2021-11 教育经历...
图1. 水稻泛着丝粒图谱构建和着丝粒基因挖掘 该研究基于水稻完整参考基因组 (Shang et al., 2023) 和251份水稻的超级泛基因组 (Shang et al., 2022) 构建了一个高质量的着丝粒图谱,首次在群体水平上揭示了水稻着丝粒重复序列长度和序列的多样性, 分析了着丝粒重复序列在水稻亚群之间的特征,进一步探究了水稻着丝粒...
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心,以下简称“基因组所”)联合崖州湾国家实验室、中国水稻研究所等单位在学术期刊《植物细胞(The Plant Cell)》上发表了题为“Population-level e...
研究基于全球野生稻和栽培稻核心种质资源,构建了群体水平、最全面和高精度的水稻泛转座子变异图谱,全面评估了转座子对水稻驯化和育种改良中的重要作用,挖掘到多个与重要农艺性状相关的优异自然变异位点,丰富了水稻育种的可用变异库,对水稻全基因组设计育种及遗传育种改良提供了重要资源。
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)联合福建省农业科学院生物技术研究所、崖州湾国家实验室、厦门大学生命科学学院等单位在植物学顶级学术期刊New Phytologist(IF= 9.4)上发表了题为“Identification of salt tolerance-associated presence-absence variations in theOs...
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)联合崖州湾国家实验室、福建省农业科学院和云南省农业科学院等单位在New Phytologist上发表了题为Oxidative burst causes loss of tapetal Ubisch body and male sterility in rice的研究论文,该研究鉴定到了一个花药特异表达的...
研究基于全球野生稻和栽培稻核心种质资源,构建了群体水平、最全面和高精度的水稻泛转座子变异图谱,全面评估了转座子对水稻驯化和育种改良中的重要作用,挖掘到多个与重要农艺性状相关的优异自然变异位点,丰富了水稻育种的可用变异库,对水稻全基因组设计育种及遗传育种改良提供了重要资源。
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)联合崖州湾国家实验室、沈阳农业大学等单位在《国家科学评论(National Science Review)(IF=20.6)上在线发表了题为“A pan-TE map highlights transposable elements underlying domestication and agronomic traits in Asian rice”...