髓系白血病中RBFOX2与m6A修饰的caRNA的结合调控基因表达 这项研究表明了YTHDC1与PRC2复合物相互作用以抑制髓系细胞中染色质的可及性。 当YTHDC1被募集到基因启动子区域时,不仅使m6A修饰的启动子相关RNA(paRNA)不稳定,还介导H3K27三甲基化从而抑制转录,而这一过程依赖于RBFOX2。因此,该研究揭示了RBFOX2作为染色...
基于CLIP技术可以在整个转录组水平上检测RNA结合蛋白的结合位点或RNA修饰(m6A)位点。CLIP根据细胞处理方式和检测方式的不同,分为HITS-CLIP、PAR-CLIP、iCLIP。iCLIP(individual nucleotide–resolution cross-linking and immunoprecipitation)是一种单核苷酸分辨率的CLIP。该技术与普通CLIP的区别在于RNA结合序列5’端的接头...
该研究通过数据整合分析和一系列生化实验,成功鉴定出染色质结合RNA上m6A修饰的识别蛋白RBFOX2。RBFOX2特异性地招募m6A MTC的组成成分RBM15至基因启动子区域,从而对启动子区域的RNA进行甲基化。与此同时,RBM15结合YTHDC1,将PRC2复合体招募到RBFOX2结合的启动子区域,从而实现染色质的沉默和转录抑制。此外,该RBFOX2/...
Dou, Xiao, Shen, Wang et al. show that RBFOX2 recognizes m6A on chromatin-associated RNAs and recruits RBM15, YTHDC1 and PRC2 to facilitate transcription suppression. Inhibition of the axis exerts anti-leukaemic effects.doi:10.1038/s41556-023-01213-wXiaoyang,Dou...