首先安装funkyheatmap 包, 1)先使用mtcars数据绘制 #devtools::install_github("dynverse/dynbenchmark/package") install.packages("funkyheatmap") library(funkyheatmap) library(dplyr, warn.conflicts = FALSE) library(tibble, warn.conflicts = FALSE) library(tidyverse) data("mtcars") funky_heatmap(mtcars...
1)先使用mtcars 数据绘制 代码语言:javascript 复制 #devtools::install_github("dynverse/dynbenchmark/package")install.packages("funkyheatmap")library(funkyheatmap)library(dplyr,warn.conflicts=FALSE)library(tibble,warn.conflicts=FALSE)library(tidyverse)data("mtcars")funky_heatmap(mtcars) 使用mtcars类似的...
library(funkyheatmap) 示例数据 今天用到的是diamonds数据,非常经典的dataset。 dat1 <- diamonds %>% rownames_to_column(., "id") %>% head(20) DT::datatable(dat1) 简单可视化 大家直接使用funky_heatmap即可,是不是颜值还不错。 funky_heatmap(dat1, column_info = NULL, row_info = NULL, co...
error_reasons <- tibble( 5,绘制funky heatmap 完成上述设置后终于可以绘制funky heatmap了 g <- funky_heatmap( 图片 OK,这样每个患者(id)的临床信息,组学信息,分组信息,就都可以可视化展示了! 参考资料: http://funkyheatmap.dynverse.org/ http://funkyheatmap.dynverse.org/articles/dynbenchmark.html ...
今天介绍一个可视化展示方式,funkyheatmap-R包 , 可以为基准数据生成热图式可视化的函数,可以使用列和行的注释对其进行微调 。效果如下 一 载入R包,数据 首先安装funkyheatmap 包, 1)先使用mtcars 数据绘制 使用mtcars类似的数据进行绘制即可,默认情况下绘制每一列的信息,后面就是参数修改以期达到封面图的效果。
funkyheatmap |临床+组学+分组数据可视化“神器”,时髦的热图 临床数据一般是使用图表汇总Table1的方式进行展示,例如R|tableone 快速绘制文章“表一”-基线特征三线表或者 gtsummary|巧合-绘制多种数据汇总表“神器” 。 今天介绍一个可视化展示方式,funkyheatmap-R包 , 可以为基准数据生成热图式可视化的函数,可以使用...
最近用到的有个包感觉很不错,分享给大家,funkyheatmap包。😘 完美可视化数据,包括字符型和数值型。🤩 这个包是出自Nature Biotechnology中,文章在这里:👇 Saelens, W., Cannoodt, R., Todorov, H. et al. A comparison of single-cell trajectory inference methods. Nat Biotechnol 37, 547–554 (2019...
Releases 0.5.0 funkyheatmap 0.5.0Latest Compare rcannood released this 02 Sep 06:55 · 23 commits to main since this release 0.5.0 15327fb NEW FUNCTIONALITY Allow specifying different columns in data for determining the colour and size of the geom using id_colour and id_size, respectively ...
library(funkyheatmap) library(dplyr, warn.conflicts = FALSE) library(tibble, warn.conflicts = FALSE) data("mtcars")You can visualise the dataset as follows.funky_heatmap(mtcars)Customising the plotHowever, this plot can look so much better if you provide additional metadata for the rows and ...
今天介绍一个可视化展示方式funkyheatmapr包可以为基准数据生成热图式可视化的函数可以使用列和行的注释对其进行微调 funkyheatmap临床+组学+分组数据可视化“神器”,时髦的热图 临床数据一般是使用图表汇总Table1的方式进行展示,例如R|tableone 快速绘制文章“表一”-基线特征三线表 或者 gtsummary|巧合-绘制多种数据汇总...