网络毒理学是指构建特定的网络模型，描绘研究对象的毒理学性质，应用网络剖析预测药物的毒性，从而了解药物对机体的毒副作用并预测药物的毒性成分。自Barabási等于2004年提出相关技术概念以来，网络生物学(networkbiology)已经成为当前生物医药研究的重要方法。这类研究大多采用无标度网络等网络建模技术，描述研究对象的复杂...
3、网络毒理学分析 3.1PM-D肝毒性靶点和网络构建 经药物靶点预测和疾病靶点收集共获得了30个目标靶点网络构建结果显示mTOR、PIK3CA、AKT1、EGFR、ERBB2、ESR1、RPS6KB1、CTNNB1是核心的相关靶点（图4）。图4 | 网络构建及靶点分析 （A）共同靶标集合 （B）药物-靶点-疾病网络 （C）PPI网络。3.2 GO和KEGG...
然而,综合网络药理学发展经验及多数网络毒理学实验设计来看,现阶段的网络毒理学研究方法尚不完善,存在方法套路化、学术思维固化、数据库更新缓慢、分析工具落后、数据使用欠规范、实验结果假阳性以及缺乏有效的结果验证等问题[5-8]。 以代谢组学、转录组学...
是不是简单的套路,但是文章的质量却很高,用生活中最常见的增塑剂,探讨了乳腺癌与增塑剂之间的复杂相互作用。网络毒理学研究思路因其发文量少、竞争小,且无需实验操作而备受青睐;而纯生信分析采用TCGA数据库、PPI网络和分子对接等常规套路,只需更换研究材料,即可轻松复现文章。感兴趣的朋友们赶紧收藏这个思路,跟随小云,...
1，研究采用网络毒理学和分子对接分析方法，对ATBC的潜在脑毒性进行了全面的分析。该方法结合了生物信息学、基因组学和大数据分析，快速、全面地揭示毒物与病理之间的复杂分子关系；2，通过网络毒理学和分子对接分析，鉴定了ATBC对大脑的潜在靶点；3，通过整合关键通路富集分析，揭示了ATBC对大脑的潜在毒性机制，为评估...
1.创新的网络毒理学思路:首先网络毒理学是个新研究方向,创新度较高、发文较少、竞争小,而且可以纯生信、不做实验~ 2.套路简单的纯生信:常规套路TCGA数据库+PPI+分子对接,这种方法的套路相对简单,通过改变研究的生物材料或疾病类型,文章轻松复现~ 看到这些熟悉的方法是否让你感到更加得心应手?如果你正在为毕业或职...
1,研究采用网络毒理学和分子对接分析方法,对ATBC的潜在脑毒性进行了全面的分析。该方法结合了生物信息学、基因组学和大数据分析,快速、全面地揭示毒物与病理之间的复杂分子关系; 2,通过网络毒理学和分子对接分析,鉴定了ATBC对大脑的潜在靶点; 3,通过整合关键通路富集分析,揭示了ATBC对大脑的潜在毒性机制,为评估潜在环境...
网络毒理学+分子对接+乳酸化+实验机制解析!!! 题目:低水平暴露于BDE-47会通过TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路促进前列腺癌的发展 英文名:Low level exposure to BDE-47 facilitates the development of prostate cancer through TOP2A/LDHA/lactylation positive feedback circuit...
本工作旨在通过整合网络毒理学和空间代谢组学策略来探索PM-D的肝毒性机制。我们基于八种关键毒性成分的毒性靶点预测和肝毒性靶点集,构建了PM-D的肝毒性相互作用网络,后富集关键信号通路,并进行分子对接验证,评估有毒成分与核心靶点的结合能力;采用小鼠肝组织病理变化和血清生化检测方法评价口服PM-D对小鼠的肝损伤作用;...
在中药毒理学研究中,相关数据库及工具地使用有利于简便而快速地提供、分析和解释相关药物毒理学信息。因此,对常用数据库、毒性预测工具和可视化工具的最新信息进行总结对促进网络毒理学完善和发展具有重要意义。 1.1常用数据库 目前,用于网络毒理学研究的主流数据库有毒理学数据网络(TOXicology data NETwork,TOXNET)、基因...